Zaten öyle yapıyorum.Bukkitlerde öyle bir sorun var.Onun yerine vanilla server kur.Yada şunu dene.Bukkit serverı açıp bi commanf-d blok koy ve üstüne düğme koy.Ardından komut bloğunun çalışma ihtimali var.Garanti değil yalnız.
Server bukkit olduğundan işe yaramaz.Bunu yapsa bile server o yazıyı kaldırcaktır.server.properties dosyasına şu kodu yapıştır ve sorun bitsin.
enable-command-block=true